Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms