Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP3K13O43283 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms