Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms