Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GNPATO15228 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GNPATO15228 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GNPATO15228 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GNPATO15228 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPATO15228 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPATO15228 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPATO15228 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPATO15228 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPATO15228 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPATO15228 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPATO15228 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPATO15228 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPATO15228 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPATO15228 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPATO15228 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPATO15228 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPATO15228 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPATO15228 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPATO15228 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPATO15228 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms