Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCSO14618 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCSO14618 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCSO14618 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCSO14618 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCSO14618 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCSO14618 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCSO14618 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCSO14618 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCSO14618 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCSO14618 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCSO14618 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCSO14618 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCSO14618 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCSO14618 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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