Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms