Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms