Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A6Q9Y2P4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A6Q9Y2P4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A6Q9Y2P4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A6Q9Y2P4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A6Q9Y2P4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A6Q9Y2P4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A6Q9Y2P4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A6Q9Y2P4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A6Q9Y2P4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A6Q9Y2P4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A6Q9Y2P4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms