Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms