Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms