Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VTI1BQ9UEU0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms