Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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