Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCM1Q9NP62 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCM1Q9NP62 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms