Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCC2Q9HCC0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms