Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms