Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms