Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms