Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms