Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms