Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYD88Q99836 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms