Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYCBPQ99417 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms