Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms