Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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