Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms