Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF21BQ96EK2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms