Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms