Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms