Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms