Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR4A3Q92570 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms