Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAAF4Q8WXU2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms