Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW36

ZCCHC13, Zinc finger CCHC domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC13Q8WW36 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ZCCHC13Q8WW36 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ZCCHC13Q8WW36 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms