Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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FAM71DQ8N9W8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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FAM71DQ8N9W8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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FAM71DQ8N9W8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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FAM71DQ8N9W8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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FAM71DQ8N9W8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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FAM71DQ8N9W8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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FAM71DQ8N9W8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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FAM71DQ8N9W8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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FAM71DQ8N9W8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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