Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms