Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME9Q86XW9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME9Q86XW9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms