Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms