Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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