Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q6Q795 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q6Q795 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q6Q795 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q6Q795 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q6Q795 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q6Q795 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q6Q795 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q6Q795 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q6Q795 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Q6Q795 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Q6Q795 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Q6Q795 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q6Q795 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q6Q795 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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