Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCSAPQ6IQ19 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms