Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
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USPL1Q5W0Q7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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USPL1Q5W0Q7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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USPL1Q5W0Q7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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USPL1Q5W0Q7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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USPL1Q5W0Q7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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USPL1Q5W0Q7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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