Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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SAMD13Q5VXD3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SAMD13Q5VXD3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SAMD13Q5VXD3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SAMD13Q5VXD3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SAMD13Q5VXD3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SAMD13Q5VXD3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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