Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms