Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPAT3Q53EU6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms