Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms