Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CTF1Q16619 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CTF1Q16619 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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