Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC37Q16543 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC37Q16543 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms