Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB1Q16531 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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DDB1Q16531 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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