Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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