Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms