Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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