Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms